La température et bien entendu la transparence à la longueur d'onde de 253,7 nm du médium sont déterminants pour désinfecter l'eau. Plus les pertes d'énergie dues à l'absorption sont importantes, moins il reste d'énergie pour la destruction des agents pathogènes.

Par principe, les sels ferreux et les apports organiques absorbent la plus grande quantité d'énergie UV. La turbidité (longueurs d'onde supérieures à 400 nm) ne permet en revanche pas de tirer beaucoup de conclusions. En outre, l'absorption augmente de façon exponentielle en fonction de l'éloignement dans l'eau de la source de rayonnement.